این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
مجله پزشکی ارومیه، جلد ۲۸، شماره ۸، صفحات ۳۳-۴۱
عنوان فارسی Introducing two new loci of VNTR۹ and VNTR۱۰ for Bordetella pertussis genotyping
چکیده فارسی مقاله
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی VNTR9 and VNTR10, two newly-found variable-number tandem repeat loci useful in MLVA genotyping of Bordetella pertussis
چکیده انگلیسی مقاله Background & Aims: Bordetella pertussis, the causative agent of whooping cough, continues to infect human hosts even in those populations where infants and children are routinely vaccinated. Causes of pertussis epidemiology are not fully identified unless strains of the pathogen are characterized by molecular means. Golbally, Multi Locus Variable Number of Tandem Repeats analysis (MLVA) has proved very useful in inter-laboratory surveillance of majoriy of world most important bacterial diseases. This work was conducted to improve the current MLVA typing method developed by Schouls in 2004. Materials & Methods: An in silico search was comparatively conducted on the whole genomes of 5 laboratory/vaccine strains of B. pertussis deposited in the NCBI genome database by Tandem Repeat Finder software. PCR protocols were then adopted to enable simultaneous amplification found loci. A further comparative genomic analysis of 20 world-known B. pertussis strains from diverse spatial and temporal origins was performed using the detected new VNTR loci. Results: Two polymorphic loci carrying tandem repeats (TRs) with 6 (AAGCCC) and 9 (GGCTGGCCG) nucleotides were detected and designated as VNTR9 and VNTR10, respectively. Application of these on genomic templates from B. pertussis 107 and B. pertussis 509 vaccine strains used by Razi institute in manufacturing the pertussis vaccine resulted in succesful production of PCR amplicons from both strains. Nei's diversity indices of 0.38 and 0.1 were achieved by these loci, respectively in comparative genomic analysis of B. pertussis strains from across the world. Conclusion: We assume inclusion of VNTR9 and VNTR10 in MLVA analysis of clinical isolates of B. pertussis is useful in improving current understanding of pertussis in Iran.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله whooping cough, Epidemiology, Strains
نویسندگان مقاله فرناز برومند آزاد | farnaz boroumand azad
razi vaccine and serum research institute, karaj, iran

سازمان اصلی تایید شده: موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی (Razi vaccine and serum research institute)

کیوان تدین | keyvan tadayon
associate professor of microbiology, razi vaccine and serum research institute, areeo, karaj, iran

سازمان اصلی تایید شده: موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی (Razi vaccine and serum research institute)

مجتبی نوفلی | mojtaba noofeli
associate professor of microbiology, razi vaccine and serum research institute, areeo, karaj, iran

سازمان اصلی تایید شده: موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی (Razi vaccine and serum research institute)

رایناک قادری | rainak ghaderi
associate professor of microbiology, razi vaccine and serum research institute, areeo, karaj, iran

سازمان اصلی تایید شده: موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی (Razi vaccine and serum research institute)

محمد سخاوتی | mohammad sekhavati
associate professor of microbiology, razi vaccine and serum research institute, areeo, karaj, iran

سازمان اصلی تایید شده: موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی (Razi vaccine and serum research institute)

سمانه ساعدی | samaneh saedi
pasteure institute


معصومه فتاح مقدم | masoumeh fatah moghadam
islamic azad university, damghan branch

سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی علوم و تحقیقات (Islamic azad university science and research branch)

ابراهیم عباسی | ebrahim abbasi
associate professor of microbiology, razi vaccine and serum research institute, areeo, karaj, iran

سازمان اصلی تایید شده: موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی (Razi vaccine and serum research institute)

نشانی اینترنتی http://umj.umsu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3252-1&slc_lang=en&sid=fa
فایل مقاله دریافت فایل مقاله
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده میکروبیولوژی
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی(توصیفی- تحلیلی)
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات